軒轅身邊的很多謀臣一再建議，要乘勝追擊，萬不可放走蚩尤，不然後患無窮。軒轅採納了群臣的意見，命應龍帶領三路軍隊堵截蚩尤的去路。又命常先、大鴻作好正面進攻準備，命風後、王亥把經過訓練的300多匹火畜用來組成一支歷史上最早的騎兵，還準備了80面夔牛大鼓。蚩尤的軍隊也都換上銅鐵兵器。傳說涿鹿大戰，雙方都集中了所有兵力。第一次交鋒，不分勝負。蚩尤總是利用氣候的變化，偷襲軒轅，而軒轅軍隊則把蚩尤圍得水泄不通，不給留下半點逃竄的空隙。雙方軍隊戰戰停停，整整對峙了七七四十九天。
一天中午，天氣突變，狂風大作，天昏地暗。蚩尤認為時機已到，命夸父立即傳令，準備突圍脫逃。軒轅發現蚩尤意圖，即命大鴻、常先和應龍按原計劃進行。然後又吩咐風後、王亥：“不能隨便擂戰鼓，火畜不得輕易上陣。沒有我的命令，絕不許亂動。”
狂風呼嘯，沙塵飛揚。夸父領兵突圍，被大鴻截住，雙方大戰起來。只見兵器相擊，火星飛濺。忽然一陣狂風刮過，只聽夸父慘叫一聲，跌倒在地。原來，夸父的眼睛被沙子迷住了，正在揉眼之際，被大鴻攔腰砍了一刀。驕橫的蚩尤，一聽夸父受了重傷，怒睜雙眼，像一條瘋狗。他掄起板斧，左右拼殺，領兵衝出重圍，殺出一條血路。軒轅發現蚩尤拼命突圍，即命應龍率騎兵跨上火畜，又命風後擂鼓接應。
蚩尤兇猛異常，力大無窮，越戰越猛。不料，應龍率領的騎兵忽然衝殺過來，銳不可擋，一下子打亂了陣腳。蚩尤根本沒有料到，軒轅還有騎著火畜打仗的騎兵。他見形勢十分不利，便命令全軍立刻撤退。這時，軒轅把手一揮，800面夔牛大鼓一齊擂嗚。傳說這種夔牛大鼓，聲震500里。蚩尤軍隊被鼓震得耳聾眼花，東倒西歪，驚慌失措，潰不成軍。軒轅命六路大軍，借鼓聲威力，發起總攻，一舉把蚩尤軍隊全部消滅在涿鹿之野。蚩尤見大勢已去，只好一人逃進一片楓樹林。應龍趕上將他活活擒住，還沒等到軒轅趕到，應龍手下一名小將，手起刀落，將蚩尤的頭砍落在地。這個蠻橫霸道不可一世的罪魁禍首，就這樣結束了他的性命。
這時，常先、大鴻和風後押著蚩尤身邊的軍師——風伯和雨師，還有受了重傷的夸父走了進來。蠻角一見，舉刀要砍，被軒轅阻止。風伯、雨師跪在軒轅面前認罪，表示願意歸順軒轅。軒轅指著蚩尤的屍體說：“蚩尤殘暴成性，一意孤行，不聽勸阻，這就是他應得的下場。但他發現了金石，教民學會了冶煉銅鐵，這又是他的一份功勞……”風伯、雨師聽了這話更加佩服軒轅的寬大胸懷，心裏十分感激。他倆請求把蚩尤的屍體妥善安葬，軒轅立即答應了。
傳說，黃帝與蚩尤一共打了三年仗，交鋒了72次，前後經過阪泉之戰、冀州之戰和涿鹿之戰。最後把蚩尤消滅在涿鹿之野。
遠古時代的這場戰爭，結束了部落時代的歷史，各部落的人都願歸順軒轅，一致擁戴他為盟主。從這時起，世界上第一個中央有共主的國家建立起來了。中華民族開始形成了，從此以後，人們都尊稱軒轅黃帝為中華民族的始祖。
