9月 1日 根據臺當局通過的所謂“大陸人民來臺觀光安全管理問題專案檢討報告”，臺當局今日起將對大陸游客赴臺觀光進行嚴格的業務審查。

9月 2日 台灣“最高法院”日前駁回製造“８·２６”惡性私渡事件４名罪犯的上訴，維持原判，以殺人等罪終審判處主犯王中興死刑。

9月 3日 今天國務院台灣事務辦公室新聞發言人在回答記者提問時表示:陳水扁所謂“國號簡稱”的言論，再次暴露了他企圖製造“台獨”分裂的本質。

9月 3日 台灣“國防部長”李傑今天上午在一次公開活動中再度為6108 億元軍購案請命，他強調，“國防”安全必需靠自我防衛。

9月 4日 第四屆全球華語歌曲排行榜頒獎典禮在台灣大學綜合體育館隆重舉行。周傑倫、孫燕姿分別獲得華語歌壇年度最受歡迎男、女歌手大獎。此次活動空前地有十五組、十九位大陸歌手參加。

 9月 5日 國民黨基本論述草案經過全省舉辦四場座談後已定調。這份草案中有關“國家”認同部分強調，“中華民國是台灣人民利益的最大公約數”，並以“反對改變現狀，也不接受一國兩制”的立場重申維持現狀的主張。

9月 6日 臺聯黨草擬的“兩岸政策萬言書”出爐，主張對大陸配偶與移民發放“永久居留證”取代“身份證”，保障其工作、醫療權，但限制其參政權。聲稱大陸人士赴臺需簽署“一邊一國”、“承認台灣為主權獨立國家”的切結書。

9月 6日 臺“國防部”今天首度證實向美採購的潛艇構型擁有六五○口徑的魚雷管，將可發射潛艇型戰斧巡弋飛彈，有將領稱未來攻擊“三峽大壩”或“中南海”都不成問題。

9月 6日 今天，台灣財團法人“海峽交流基金會”來函中國大陸“海峽兩岸關係協會”，對四川東北部地區的暴雨災情表達關切，並向受災民眾和家屬表達慰問之意。

9月 7日 今天武漢大學迎來了九十八名到該校就讀的港、澳、臺和華僑新生。武漢大學招生就業工作處介紹，今後報考者只要達到中國聯合招辦規定的錄取標準，武大即予以錄取，有多少錄取多少，不受名額限制，且充分滿足學生填報的專業志願。

9月 7日 台灣旅行商業同業公會聯合會秘書長許高慶在接受媒體採訪時表示，大陸旅客消費能力很強，如果不全面開放大陸旅客來臺觀光消費，搶佔大陸觀光旅客市場的商機，等到一、二年過後，台灣旅遊市場的優勢將消失殆盡。

9月 8日 一直極力推動“台獨”活動的李登輝近日決定，將在明年2 月28 日發動“公投制憲”百萬人大型活動，而原定11 月27 日舉辦的所謂“百萬人點燈”活動，則調整為明年“二二八公投制憲”的預演活動。

9月 8日 廈門舉辦的第八屆中國投資貿易洽談會，參展的臺商達到一千零二十三人，數量為歷屆最多。參會臺商層級也比以往有所提高，規模創歷屆之最。

9月 9日 參加第八屆中國投資貿易洽談會的國務院副總理吳儀今日在廈門與臺商座談。吳儀副總理向與會臺商表示，今後政府將進一步採取積極措施，鼓勵臺商到大陸投資。

9月 9日 第五十九屆聯合國大會將於十四日（美國時間）開幕。今天，台灣“行政院”新聞局長林佳龍說，陳水扁定於9 月15 日與“駐聯合國記者協會”會員舉行視訊會議，“以現代科技突破對岸封鎖、打壓，直接向世界表達台灣參與聯合國的決心”。聯合國秘書長安南今天接受媒體詢問時說，他不清楚此事的細節，“但聯合國的一個中國政策不會改變。”

9月 10日 台灣“中國石油公司”（中油）與大陸“中國海洋石油總公司”（中海油）計劃在澎湖附近的海域合作探勘石油、天然氣。

9月 10日 廈( 門) 金( 門) 自二00 一年一月二日正式開通直航航線以來，以其方便、快捷、實惠等優勢，逐漸成為臺胞往來兩岸的首選路線。今日廈金航線旅客流已經超過五十萬。

9月 11日 陳水扁今天下午在接見日本眾議員村上誠一郎及鴨下一郎時聲稱，台灣與日本“兩國”是最好的夥伴與同盟：包括是“價值同盟”、“經貿夥伴”與“軍事同盟”。

9月 12日 島內反軍購社團組織今日稱，臺軍方公佈的“軍購說帖”，已完全失去“臺軍應有的道德與客觀性”。此外，他們計劃在25 日舉行“反6108 軍購”大遊行。

9月 13日 今日，由湖南省湘臺交流促進會與湖南大學岳麓書院聯合舉辦的“湖湘文化傳統與現代人文精神”研討會在岳麓書院開講。來自台灣十多所學院的二十四名專家教授與大陸學者進行了學術研討。

9月 14日 聯合國今日發函給聯合國記者協會會長簡金斯表示，將禁止記者協會利用越洋視訊，與台灣地區現任領導人陳水扁進行對話。臺當局今晚也證實，視訊會議已確定無法于聯合國大廈內舉行，可能將改在附近的飯店進行。

9月 14日 1987年至今，台灣居民來大陸累計近3200萬人次，而大陸居民赴臺累計僅96萬人次，兩岸人員往來極不平衡。國臺辦交流局有關負責人說，台灣當局迄今不開放大陸居民赴臺旅遊，對兩岸交流採取種種限制措施，是兩岸人員往來失衡的根本原因。

9月 15日 第59 屆聯合國大會總務委員會今日作出決定，不將查德等極少數國家提出的所謂“2300 萬台灣人民在聯合國代表權問題”提案列入本屆聯大議程，從而再次挫敗了台灣當局分裂祖國的圖謀。這也是台灣當局在聯合國製造“兩個中國”、“一中一台”的企圖連續第12 次遭到挫敗。

9月 16日 為籌募明年2 月時的“公投制憲”的“台獨”活動經費，今日晚，李登輝當場自捐100 萬元新台幣。並在鼓勵眾人捐錢時稱，“中華民國”已不存在，台灣的“國號”是“台灣國”，應該繼續推動“公投制憲正名”，並說大陸要求對台灣和平統一已經沒有希望。

9月 17日 據臺媒報道，美國前副助理國務卿凱澤因涉嫌對臺泄密事件被捕，凱澤被指和台灣一位駐美女情報員往來密切，曾經多次提供訊息。

9月 18日 身兼國民黨副主席的“立法院長”王金平今天表示，在“國家定位”與兩岸政策上，他仍主張定位在“兩岸兩區”，他說，兩岸應修先創造雙方可接受的模糊空間，以“兩岸兩區”尋求和解。

9月 18日 廈金直航貨輪“泉豐一六六”號，今日運載十八多噸金門高梁酒靠泊廈門同益碼頭，這是廈金航線開通以來直航貨輪首次承運金門至廈門的貨物。

9月 19日 今日發表的中共十六屆四中全會公報指出，解決台灣問題、實現祖國的完全統一是黨肩負的神聖使命。要貫徹“和平統一、一國兩制”的基本方針和現階段發展兩岸關係、推進祖國和平統一進程的八項主張，推進祖國統一大業。堅決反對和遏制“台獨”分裂勢力，堅定不移地捍衛國家主權和領土完整。

9月 20日 《禁止化學武器公約》第二屆亞洲地區國家履約機構會議今日在北京開幕，中國外交部副部長張業遂做主旨發言時說，中國一直把在“一個中國”框架下，推進公約在香港、澳門和台灣地區的實施作為努力的方向。中方願在“一個中國”前提下，妥善解決公約在台灣地區的實施問題。

9月 20日 今日下午，“湖北·武漢台灣周”正式開幕。國務院台灣事務辦公室常務副主任李炳才出席大會發言時，倡議海峽兩岸經濟界人士當攜手共進，加強兩岸經濟交流與合作，以促進中華民族的長期繁榮、穩定。

9月 21日 台灣現行的婚姻管理制度即將出現重大變革，臺“內政部”計劃修改規定，將現行的婚姻“儀式婚”改為“登記婚”；未來結婚必須在雙方當事人，向戶政機關辦理戶籍登記後才算生效；與大陸人士結婚者，則須等大陸人士通過面談程式，才能辦理結婚登記。

9月 21日 台灣“經濟部”今天指出，台灣1 至8 月海外投資較去年增長24.60% ，對大陸投資則大增60.50% 。1 至8 月核準大陸投資件數為1474 件。若以投資地區分，主要集中在江蘇省，佔到55.42% 。

9月 22日 陳水扁的“兩岸和平綱領”遲遲沒有出來，島內十多個民間團體率先公佈“兩岸和平綱領草案”，要求兩岸共同研擬“中程協議”，在2050 年前完成雙贏的“統合關係”。

9月 22日 根據臺軍方“未來5 年兵力整建與施政計劃”，臺軍精進案將於2009 年達成，比原訂計劃提前3 年。除了6000 多億元（新台幣，下同）特別軍購之外，未來5 年臺軍所需開銷估計達到1.6 兆元，但是臺“行政院”能提供的預算只有1.2922 兆元，赤字將達到3000億.

9月 23日 臺軍方高層透露，經過五年爭取，美方終於應允售臺曾在海灣戰爭和美伊戰爭中建功的AGM-88HARM 高速反輻射導彈。據悉，這是美方首度售臺先進攻擊性武器，據稱, 這種導彈可癱瘓、破壞大陸東南沿海各導彈陣地部署的防空及戰管系統雷達。

9月 23日 今天，執行兩岸雙向遣返任務的“海峽號”船又從馬祖接回一百三十一名私渡去臺人員。“海峽號”在不到一個月的時間內進行了三次遣返作業，這是過去少有的。

9月 24日 台灣“行政院長”遊錫堃今日表示，為落實台灣主體性，他將要求“外交部”、相關單位在公文中，將對岸稱呼為“中國”，而中國指的就是中華人民共和國。國民黨政策會副執行長兼大陸部主任張榮恭對此表示，這種說法是落實“一邊一國”以及"去中國化”。

 9月 25日 臺“行政院長”遊錫堃今日在談到軍購話題時稱，兩岸之間必須維持“軍力平衡”，才能避免戰爭。遊錫堃的說法立刻引來臺政壇在野黨的批評。國民黨主席連戰批評遊錫堃“恐怖平衡”的說法“匪夷所思”。

9月 25日 今天，第二屆中國·天津媽祖文化旅遊節在天津開幕。台灣北港朝天宮、大甲鎮瀾宮、金門媽祖廟，福建湄洲媽祖廟等12 個宮廟的代表為聖像安座，並將各自帶來的水、土匯入四海安瀾瓶和坤澤四方鼎，象徵著中華民族同祖同宗、同根同源。

9月 26日 台灣經濟主管部門進行的一項大型調查顯示，台灣大企業中認為當局應儘速改善兩岸關係的比率直逼四成，不但高居各選項之冠，也創下歷次調查最高紀錄，顯示企業對改善兩岸關係的迫切感日益升高。

9月 27日 中共中央政治局常委、全國政協主席賈慶林今天在當選中國和平統一促進會新一屆理事會會長後發表講話。他說，我們將深入貫徹“寄希望於台灣人民”的方針。

9月 28日 500 多位港澳臺及海外僑胞今天聚首北京政協禮堂，共慶中華人民共和國建國55 週年。

9月 29日 祖國大陸接連三次接回部分滯臺私渡人員。據臺媒報道，臺“陸委會”主委吳釗燮今天期盼能重啟兩岸協商，讓遣返作業更上軌道。

9月 29日 美國國會一份報告指出，在過去8 年，台灣在軍購上花了190 億美元，在發展中國家或地區中排名第二。佔全球發展中國家或地區的軍購金額的10.3% ，僅次於沙烏地阿拉伯。

9月 30日 中國外交部長李肇星今日在美國華盛頓美洲國家組織總部會見該組織秘書長羅德里格斯時感謝美洲國家組織各成員國最近協商一致吸納中國為常駐觀察員。他強調，自此中國代表權問題已從政治上、法律上、程式上得到解決。台灣作為中國的一個省，根本沒有資格以任何名義或形式參與美洲國家組織。

9月 30日 美國務卿鮑威爾今日在回答媒體詢問時表明，台灣問題的解決方式不能只顧及台灣人民，而是兩岸人民能不能接受。（何菁）