為搜尋2004年4月傳染性非典型肺炎疫情在北京、安徽發生的原因，衛生部成立了由軍事醫學科學院、北京市疾病預防控制中心和中國疾病預防控制中心傳染病預防控制所7位專家組成的調查組，對本次疫情的來源進行了專項調查。WHO的專家參與了部分調查工作。

　　調查認定，這次非典疫情源於實驗室內感染，是一起因實驗室安全管理不善，執行規章制度不嚴，技術人員違規操作，安全防範措施不力，導致實驗室污染和工作人員感染的重大責任事故。

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　　吳儀指出，這起事故的發生，不僅損害了人民群眾的健康，也對經濟社會發展造成了一定損失，令人十分痛心，教訓十分深刻。對相關責任人員作出嚴肅處理，體現了黨和政府對人民高度負責的精神和對廣大科研人員健康安全的關心與重視。有關部門和單位必須引以為戒，防止類似事故的再次發生。

　　吳儀強調，加強實驗室生物安全是當前一項重要而緊迫的任務。要抓緊制定實驗室生物安全管理法規，依法加強生物安全管理。要增強安全意識，完善規章制度，加強實驗室規範化建設，把生物安全管理責任和措施落到實處，消除安全隱患。要改善科研條件，嚴格執行科研人員健康監測報告制度，落實定點醫院治療辦法，有效保護科研人員健康安全，防止疾病擴散。

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　　今年非典疫情來源查明，中國疾控中心數人承擔責任。中國疾控中心主任李立明等人因對非典病毒管理不善負有重要領導責任，引咎辭職。中國疾病預防控制中心新主任王宇，七月一日在衛生部召開的中國疾病預防控制中心幹部職工大會上首次亮相。此前他是國家科技部農村與社會發展司副司長。

　　王宇表示，接受新工作感到責任重大，但有信心做好。他說，一個繁榮、富裕、安定的社會首先是健康社會；中國建設全面小康社會，對疫病預防控制和健康促進提出了新的要求。中國疾病預防控制中心擔負者國家疾病預防控制和公共衛生建設的任務，事關重大，工作稍不到位，就會影響社會穩定、經濟發展甚至國家安全；目前疾控和公共衛生事業建設離國家要求和疾控工作實際需要還有較大差距，既有硬體改善的工作，又有管理上要調整、規範和強化的任務。

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　　4月22日北京發現一例疑似SARS病例。

　　4月23日，衛生部公佈病例確診，患者是北京市健宮醫院的李姓護士。北京迅速對病人李某及其父母隔離，並連夜尋訪醫院外的密切接觸者。180多名密切接觸者全部納入監控範圍實施醫學觀察；已經出現發熱症狀的5名密切接觸者全部實施隔離治療。

　　幾乎同時，安徽也出現兩例SARS病例：安徽醫科大學的學生宋某和她的母親。

　　北京和安徽在發現SARS病例之後迅速啟動了SARS預警和防治機制，並向世界衛生組織通報。

　　北京不久又公佈一位在中國疾病預防控制中心病毒病所工作的博士生楊某感染非典。楊某和宋某都曾在中國疾病預防控制中心病毒病所進行過研究工作。而首例患者李某則是曾護理宋某的護士。

　　4月23日下午3時，衛生部責成北京市政府對可能已出現實驗室感染的中國疾控中心病毒病所工作人員161人採取隔離措施。直到5月7日解除隔離，這些人員中無人繼發感染非典。

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