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病機，是指疾病發生、發展、變化及其結局的機理。以陰陽五行、氣血津液、藏象、經絡、病因和發病等基礎理論，探討和闡述疾病發生、發展、變化和結局的機理及其基本規律，即病機學說。病機的理論，在《黃帝內經》中已奠定了基礎，病機之名，首見於《素問·至真要大論》的“審查病機，無失氣宜”和“謹守病機，各司其屬”。病機的理論在《黃帝內經》中已奠定了基礎。如《素問·至真要大論》的“諸風掉眩，皆屬於肝……”等“病機十九條”，是以“五運六氣”的“六氣”與五臟相應的理論，將臨床常見的諸多症狀，分別歸屬於心、肺、脾、肝、腎之疾患，風、寒、濕、熱、火之疾患，病變部位是在“上”或“下”等。但必須指出：《內經》之論述病機，內容非常廣泛，並不局限于“病機十九條”，它與邪正和陰陽之盛衰，氣血和臟腑之虛實，以及某些病證（如疼痛、痿、痹、厥、癰疽等）的病機，均有詳盡的論述。
歷代醫家對於病機學說均非常重視。漢代張仲景的《傷寒雜病論》在《素問》及《靈樞》的基礎上，結合臨床實踐闡述了熱病的虛實、寒熱、表裏、陰陽的進退變化；在《內經》臟腑、經絡虛實的基礎上，對不少病證的病機進行了闡述。隋代巢元方的《諸病源候論》對1729種病候的病因、病機、及其臨床證候作了闡述，成為我國歷史上最早的病因病機學專著。金元時期的劉河間在《素問·玄機原病式》中提出“六氣皆從火化”和“五志過極，皆為熱甚”的觀點；李東垣在《內外傷辨惑論》中，論述了“內傷脾胃，百病由生”和“火與元氣不兩立”的病機；張從正在《儒門事親》中論述了“邪氣”致病的病機；朱丹溪在《格致余論》中闡釋了“陽有餘而陰不足”和“濕熱相火”等病機。
病機學說的具體內容可以概括為以下幾個方面：
1.從整體上探討疾病的發生、發展、變化和結局的基本規律。如邪正盛衰、陰陽失調、氣血失常、津液代謝失常等。
2.從臟腑、經絡等某一系統研究疾病的發生、發展、變化和結局的基本規律。如臟腑病機、經絡病機等。
3.探討某一類疾病的發生、發展、變化和結局的基本規律，如六經傳變病機、衛氣營血傳變病機和三焦傳變病機等。
4.研究某一種病證的發生、發展、變化和結局的基本規律，如感冒的病機、哮喘的病機、痰飲的病機、瘧疾的病機等等。
5.研究某一種症狀的發生、發展的病機。如疼痛的機理、惡寒發熱的機理、失眠的機理等等。
6.研究由於氣血津液、臟腑等生理功能失調所引起的綜合性病機變化，如內生“五邪”。
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