秦漢時期為臨證醫學的發展奠定了基礎。西漢淳于意對內科雜病的認識與診療水準較之前代都有顯著提高，尤其辨證論治思想的確立與運用，使內科雜病的學術水準達到新的高度。在具體病證的認識上，對虛勞、肺癰、痰飲等辨證論治均有了比較系統闡述的病例。淳于意“診籍”、《治百病方》、張仲景《金匱要略》等是這一時期與內科雜病有關的重要醫學文獻，尤其後者對內科雜病的理論認識與診治技術都達到了很高的水準，成為中國傳統醫學中在內科雜病方面垂范後世的經典之作。

　　（一）淳于意“診籍”中的內科雜病病案

　　西漢初淳于意所著的《診籍》中，所記以內科雜病居多，有風蹶、熱蹶、風癉、瘧、風癉客脬、迥風、沓風、熱病、中熱、痹、腎痹、氣鬲、氣疝、涌疝、牡疝、肺消癉、肺傷、傷脾氣、遺積瘕、蟯瘕等，其中以消化系統疾病為最多。如“痹（肝腫大）”一案，淳于意為齊王診病，記錄了“根在右脅下，大如覆杯，令人喘，逆氣不能食”（《史記·扁鵲倉公列傳》）等症狀，先後用火齊粥和丸藥治愈。還有“涌疝（二便閉結）”，“風癉客脬（二便難）”，“迥風（急性腹瀉）”等案，在認識上均有所提高，“肺消癉”一例，是消渴病最旱的醫案。案中不僅記載了病因、證狀及治療經過，並以“形弊”、“屍奪”形象地描述了消渴重症患者形體消瘦的典型症狀。

　　（二）辨證論治原則的確立與內科雜病

　　春秋以前，臨證醫學基本上還處在樸素經驗的階段，治病以單味藥物為主。爾後《內經》的出現，標誌著醫學理論體系已經形成。春秋戰國以後，醫學有了較大的發展。《五十二病方》和《治百病方》兩書中所載醫方，幾乎全是復方，其中已孕育著辨證施治的雛形。從單味藥到復方，從樸素的經驗到復方配伍理論的形成以及復方的廣泛應用，是臨證醫學發展中的一個進步。

　　《金匱要略》是醫學史上第一部以內科雜病為主的專著，它集中地展現了當時在內科方面的臨證水準。書中按每類疾病的共性進行分證，重點闡述了痙病、中風、歷節、虛勞、肺癰、咳嗽上氣、胸痹、積聚、痰飲、水氣等近30種病，為後世治療學發展奠定了基礎。該書還最早確立三因致病的病因學說，豐富了內科雜病的病因學說。《金匱要略》通過大量的實踐經驗運用了脈證合參，發展了診法，從而在內科雜病方面確立了脈證並重的診斷原則，提高了內科的診斷水準。該書保存了大量的有效方劑，一直為後世醫家所沿用。同時，該書對內科急症也總結了豐富的經驗，如對痙證、中風、歷節、暴喘、胸痹、腹痛、急性出血都有比較實際的認識，而且提出了比較有效的治療方法。張氏所記載的急救方法，如救治自縊的搶救技術——人工呼吸法及注意事項與現代方法從基本理論和生理、解剖要求沒有兩樣，這是十分突出和難能可貴的。又如救卒死用薤搗汁灌鼻和救溺死方，在東漢時期應當說都是很先進的創造。