據台灣《中國時報》報道，余連發是陳水扁主政後期極少數上將任滿三年的臺軍將領。余連發對於上將職務在5月20日後將有所調整，事前心中早已有數，很早前就曾向臺軍人士表明自己將與陳水扁同進退。

    臺軍方昨天發佈新聞稿指出，余連發調職後，職務暫由臺軍後備司令部副司令李銘藤中將代理，等到11月1日後，再發佈新任司令；而余連發留下的上將職缺，也將依照臺軍“精進案”規劃，降編為中將。

    另一方面，同樣在“精進案”規劃降編的“總政戰局長”上將職缺，也將降編為中將。臺軍方官員稱，屆時臺軍原本十三名上將職缺，將只剩下十一名。