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台灣海軍原總兵力約為7萬人，其中機關和陸勤人員1.7萬人，艦艇部隊2萬人，陸戰隊3.1萬人。海軍艦隊主要由2個驅逐艦隊、2個護衛艦隊、1個掃雷艦隊、1個登陸艦隊、1個勤務艦隊、1個潛艇隊、1個導彈艇大隊和1個反潛直升機大隊組成。主要基地有高雄、左營、金門、馬公、基隆、花蓮、馬祖，中正等。陸戰隊由2個陸戰師、1個戰車團和1個輕型航空隊組成。
但經過“精實案”後，兵員由原來的68,000人減為56,000人。組織上較大的改變是陸戰隊裁撤師級單位，改編為3個陸戰旅，以及原來的艦載直升機大隊和空軍移編的反潛機隊合併，成立海軍航空指揮部。未來另一個重要的方向，是把現行的軍區制廢除，並依各艦隊母港所在地和當地陸軍部隊共同編組。但能否實現仍有變數。（綜合）
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