臺軍認為：特種作戰部隊平時是“防患未然，壯軍威，鼓民心”的堅盾，戰時是出奇制勝的“銳矛”。只有具備高超的綜合作戰能力才可在特殊天氣、地形條件下遂行並完成特殊作戰任務。為此，近年來，臺軍一是深化特種作戰理論研究，注重汲取伊拉克戰爭、阿富汗戰爭美軍特種作戰部隊成功運用的經驗，想借此創造出富有臺軍特色的特種作戰理論並用於指導訓練和作戰。

    二是強化應急作戰能力。臺軍特種作戰部隊自2005年起就按訓練計劃組織實施“八反”訓練。陸軍特種作戰部隊實施反恐，反空(機)降，反劫持、反破襲、反滲透、反斬首、反綁架、反突擊、反偷渡和反超限戰等科目訓練，並邀請美國等西方國家的特種作戰訓練教官全程指導訓練，所訓科目必經嚴格考評。

    三是頻繁參加聯合演習。近年來臺軍舉行的一系列軍演均可看見特種作戰部隊的影子。先後參與了“漢光”18號、21號、23號、“萬安”、“海安”3號等軍演，並在其中擔負重要“角色”。

    四是強化訓練科目的針對性。2006年，臺軍高層組織“非常時期”擔負“天威”特殊任務的海陸軍特種作戰部隊進行“密封式”訓練。挖掘特訓潛力，深化戰術技術科目訓練，以圖適應資訊化條件下特種作戰需要。

    主要訓練科目有：危急情況下的集結、機動、展開、特種作戰部(分)隊和特種作戰勤務部(分)隊的指揮協同、通信聯絡、電子戰、心理戰、戰勤保障、各種複雜天候氣象和地形條件下的戰術技術運用，對軍事、政治、情偵、經濟、能源、通聯、軍工、後方等重要敏感目標的警護及“反恐維穩”等。臺軍特種作戰旅還恢復了山林地戰術技術訓練，並加強了指揮控制、通信聯絡、搜剿、襲(伏)擊戰法和空地協同作戰科目的訓練，訓練的針對性和實用性都超過以往的訓練。

    臺軍的特種作戰任務除了維護治安、反恐、處理衝突外，主要以進攻性的非正規作戰為主。強調以一切必要手段(包括暗殺、綁架臃瘓敵方軍政指揮中樞的正常運作，破壞交通樞紐、軍事工業及能源設施，以傳播假資訊等方式進行心理戰，併為後續軍事行動鋪平道路。

    具體而言，一是對外，使用先進交通工具快速滲入敵方，單獨或配合其他部隊摧毀敵首腦機關、指揮通信網路、交通樞紐、核生化武器庫以及戰略導彈、飛機，艦船等高技術兵器；破壞敵方戰略資源、後勤供應基地；潛入敵要害部門竊取軍事情報，為大部隊行動創造條件；對敵方實施心理戰、策反、製造和傳播謠言等。二是對內，警戒和保護重大軍事及政治目標，平息本島或外島爆發的騷亂和危機以及擔負搶險救災任務等。

    長期以來，臺軍把特種作戰視為“決戰境外”的重要作戰方式，對特種作戰給予厚望，同時認為，特種作戰行動涉及政治、經濟、文化、宗教等一系列戰略範疇的問題，直接關係到台灣的“根本利益”。所以，臺軍在對待特種作戰行動上極為慎重。特種作戰的目的、時間、兵力、規模、強度均由臺當局“最高層”決策，行動時統一制定計劃、統一劃分區域、統一協同方式。

    作戰的指揮方式上，臺軍又強調集中指揮與分散行動相結合。特種作戰的戰場環境、作戰對手、任務性質、作戰目的、作戰手段和方式都很特殊，政治性強、影響面大。因此，特種部隊的使用和特種作戰的目標、時機、手段等重大問題應由軍政最高層親自籌劃，由較高的指揮層次集中指揮並控製作戰進程。

    由於特種作戰有很大的偶然性和突變性，臺軍又強調靈活指揮，針對戰場情況的變化，圍繞總的作戰意圖，靈活運用各種作戰手段，達成作戰目的。特種分隊可以根據戰場態勢修正原方案，機斷行事、靈活多變、果斷指揮、默契配合，從而取得特種作戰的勝利。特別是隨著資訊技術的發展，作戰對手(如恐怖分子)的武器裝備會更先進，以“特”反“恐”的能力會更強，也會增加特種部隊作戰行動的難度。在這種情況下，靈活應變指揮顯得尤為重要。

    按照臺當局的設想，臺軍特種部隊應成為臺軍的“精銳之師”，是執行“決戰境外”的核心力量。軍方高層前曾經在視察特種部隊時說“你們絕對是一群最便宜的殺手”。不管有心還是無意，這位高層官員的確一語道破天機——臺軍的特種部隊正在淪為“廉價殺手”。（綜合）